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【学习笔记】生物信息学基础知识+序列比对初步了解(一)_一段 蛋白质序列

【学习笔记】生物信息学基础知识+序列比对初步了解(一)_一段 蛋白质序列 生物信息学,简单来说就是运用计算机科学、统计学和数学方法,来分析和理解生物大分子(主要是DNA、RNA和蛋白质)的信息。它已经成为生命科学研究不可或缺的一部分,就像盖房子需要地基,生物信息学就是生命科学研究的基础。 它的核心目标是利用计算工具来揭示生物学现象背后的奥秘。 今天我们先从一个非常基础的概念入手:蛋白质序列。蛋白质是生命的执行者,它们的性质和功能都由氨基酸的序列决定。 序列比对,就是比较两个或多个蛋白质序列的差异,寻找它们之间的相似性,从而推断出它们可能具有的共同功能或进化关系。 想象一下,你手里有一段未知蛋白质的序列。要理解它的功能,你需要把它与已知蛋白质序列进行比较。 这种比较,通常通过算法来实现,比如Needleman-Wunsch算法和Smith-Waterman算法,它们能自动地找到两个序列之间的最佳匹配位置。 序列比对的关键在于评估序列间的相似度。常用的方法包括计算序列相似度得分,例如BLOSUM和PAM矩阵,它们考虑了氨基酸之间的相互作用和进化关系。 通过这些计算,我们可以得出结论:相似的序列可能来源于共同的祖先,或者具有相似的功能。 初步了解序列比对,就如同拿到了一把钥匙,开启了理解生物序列信息的入口。 接下来,我们将深入学习更高级的序列比对算法和工具,以及它们在实际研究中的应用。 掌握这些知识,将有助于你更好地理解生命科学的研究进展。 展开
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生物信息学
2025-07-30
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